1994年6月24日 (農歷五月十六)，《四庫全書存目叢書》首冊出版。
被譽為“中華文化一大盛事”的《四庫全書存目叢書》，1994年6月24日由北京大學出版社推出第一冊，終于開始了卻幾代學者的百年夙愿。
《四庫全書》是清代乾隆年間編纂的中國歷史上最大的一部叢書，共收錄歷代典籍3461種、79309卷，學術界稱之為中國傳統文化總匯。但是《四庫全書》并不“全”，大量不符合清王朝統治需要和價值標準的歷代典籍被摒棄在外，僅列為存目者即達6793種、93551卷，歷經300年來的天災人禍，存目之書亡失嚴重，現存4000余種、6萬余卷，分藏在全國200多個圖書館，三成以上已成孤本。
經國務院古籍整理出版規劃小組批準，《四庫全書存目叢書》編纂工作于1997年5月15日正式開始。經過短短40天的努力，即出版發行了第一冊。
這套叢書共1200冊，計劃分四批出版：1994年出版經部，1995年出版史部，1996年出版子部，1997年出版集部。